Nama pondok pesantren Mamba’ul Ma’arif, atau yang lebih dikenal dengan Pondok Denanyar, memang sudah tak asing lagi buat orang Indonesia lebih-lebih bagi masyarakat Jawa Timur.
Pondok Pesantren Terpadu Al-Yasini berdiri pada tahun 1940. Nama Pesantren Al-Yasini diambil dari perintis dan pendiri pesantren yaitu KH. Yasin bin Abdul Ghoni. Pada mulanya kegiatan pesantren berbentuk pengajian kalongan bertempat di musholla diikuti santri yang mukin maupun masyarakat santri yang tinggal di sekitar pesantren.
Pondok Pesantren Al-Ishlahiyah didirikan pada tahun 1955 oleh Almarhum KH. Mahfudz Kholil bersama istri dia Hj. Hasbiyah Hamid .
Pondok Pesantren Al-Khoirot didirikan oleh KH. Syuhud Zayyadi pada 1963. Beliau merupakan bagian dari keluarga besar Bany Itsbat (Bani Isbat) dengan silsilah nasab sampai ke salah satu Walisongo (Sunan Drajad / Sunan Ampel / Sunan Giri).
Yayasan Pondok Modern Al-Rifa'ie ( YPMA ) mulai dibangun pada tanggal 08 Oktober 1992 M / 11 Robiul Akhir 1413 H, oleh KH. Achmad Zamachsyari
Pada tahun 1901 lahirlah seorang pemuda Muhammad Anwar Bin H. Nuruddin di desa Sumber Taman Kabupaten Probolinggo.
Tahun 1911 M. merupakan periode perintisan berdirinya Pondok Pesantren Al Hikmah 1 yang dilakukan oleh KH. Kholil bin Mahalli
Pondok Pesantren Asrama Perguruan Islam (API) Tegalrejo didirikan pada tanggal 15 September 1944 oleh KH. Chudlori
Sejarah Pesantren Asshiddiqiyah Pondok Pesantren Asshiddiqiyah didirikan pada Bulan Rabiul Awal 1406 H ( Bulan Juli 1985 M ) oleh DR. KH. Noer Muhammad Iskandar, SQ.
Pondok Pesantren Cipasung didirikan tahun 1931 M oleh Al-Marhum Al-Maghfurlah K.H. Ruhiat.
Pondok Pesantren Lingkungan Hidup Al-Ihya Kaduronyok didirikan tahun 1993 berorientasi membentuk manusia yang berkualitas yakni manusia yang unggul dalam bidang ilmu pengetahuan dan teknologi, berwawasan ke depan, handal dalam menghadapi persaingan global
Pondok Pesantren Babakan Ciwaringin Cirebon awalnya hanya satu yakni Pondok Gede Raudlatut Tholibin terletak di Desa Babakan Ciwaringin Kabupaten Cirebon
Pesantren Raudlatul Ulum yang berdiri megah di Desa Guyangan, Kecamatan Trangkil, Kabupaten Pati, Provinsi Jawa Tengah didirikan oleh Almaghfurlah KH Suyuthi Abdul Qodir pada awal 1950-an
Yayasan Al-Asy’ariyyah yang berkantor pusat menyatu dengan Pondok Pesantren Al-Asy’ariyyah di Jalan KH. Asy’ari No. 9 berada di desa Kalibeber Kecamatan Mojotengah Kabupaten Wonosobo
Pondok Pesantren Kyai Syaikhona Mohammad Kholil Bangkalan Madura Jawa Timur Indonesia yang didirikan oleh Kyai Haji (KH) Kholil
Pada Agustus 1956, KH. Akrom Chasani bersama sembilan ulama dari berbagai daerah di Indonesia ikut rombongan Menteri Agama Indonesia yaitu KH. Muhammad Ilyas
Pondok Pesantren Darul Hikmah adalah sebuah yayasan yang bergerak dalam bidang pendidikan khususnya dalam bidang keagamaan yang mengorientasikan akhlakul karimah. pesantren yang beralamatkan Jl. Palembang-Jambi, KM 158, Desa Simpang Tungkal, Tungkal Jaya, Musi Banyuasin, Sumsel.
Adalah sebagian cerita antara Syekh Kholil dengan keluarga Ar-Rahbini. Adapun Syekh Ali Ar-Rahbini sendiri kemudian tinggal di Gondanglegi Malang.
Pondok pesantren Al jihad pontianak sebagai lembaga pendidikan dan lembaga pengembangan islam, pondok pesantren Al-Jihad didirikan pada tahun 1969. Pondok Pesantren Al-Jihad, terletak di tengah kota Pontianak beralamat Jl.Kom. Yos Sudarso Gang Sukamaju Dalam
Pondok Pesantren Musthafawiyah Purba Baru merupakan salah satu pondok pesantren yang terletak di kabupaten Mandailing Natal dan berlokasi di desa Purba Baru, Lembah Sorik Merapi, Mandailing Natal. Pesantren ini merupakan salah satu pesantren tertua di pulau Sumatra dengan usia sekitar 1 abad dan telah banyak mencetak ulama di Indonesia.