Sistem Pendidikan Pondok Mbodo mengacu pada sistem Salafiyyah, yaitu sistem pendidikan tertua di Nusantara. Sistem Salafiyyah ini antara lain adalah system Sorogan Qur’an, Mukhafadhoh/hafalan, Madrasah Diniyyah, dan memaknai kitab. Berdirinya yayasan ini didasarkan atas keinginan untuk mengembangkan ajaran agama Islam yang berbasis Ahlussunnah Wal Jama’ah dalam setiap sendi kehidupan, baik dalam dunia pendidikan, sosial, dakwah, dan lain sebagainya.

Untuk mewujudkan keinginan tersebut, maka didirikanlah beberapa lembaga pendidikan formal dan non formal. Di antaranya adalah SMP Islam Al Hawi, SMK Islam Al Hawi, Madrasah Diniyyah, dan Jurusan Pesantren. Selain di bidang pendidikan, yayasan juga bergerak di bidang sosial dan dakwah serta kesehatan. Kegiatan sosial dan dakwah meliputi majlis dzikir “NKRI”, Koin Surga, dan Tari Sufi Laskar Cinta, sedangkan kegiatan di bidang kesehatan berupa pengobatan nabawi, ilmu hikmah, ruqyah, bekam, dan minuman herbal/ jamu.